Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIP1O00291 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIP1O00291 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIP1O00291 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIP1O00291 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms