Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms