Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DEV8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DEV8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms