Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEURL1BA8MQ27 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1BA8MQ27 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms