Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms