Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms