Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms