Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms