Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms