Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD3A2A2Y4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms