Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms