Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PUF60Q9UHX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PUF60Q9UHX1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PUF60Q9UHX1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms