Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC7Q8WUI4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC7Q8WUI4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC7Q8WUI4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC7Q8WUI4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms