Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC155Q8N6L0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC155Q8N6L0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC155Q8N6L0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC155Q8N6L0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC155Q8N6L0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC155Q8N6L0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC155Q8N6L0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC155Q8N6L0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC155Q8N6L0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC155Q8N6L0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC155Q8N6L0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC155Q8N6L0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC155Q8N6L0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC155Q8N6L0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC155Q8N6L0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms