Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nup88Q8CEC0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup88Q8CEC0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup88Q8CEC0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup88Q8CEC0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nup88Q8CEC0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nup88Q8CEC0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nup88Q8CEC0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Nup88Q8CEC0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup88Q8CEC0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nup88Q8CEC0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nup88Q8CEC0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nup88Q8CEC0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms