Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP26C1Q6V0L0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP26C1Q6V0L0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP26C1Q6V0L0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP26C1Q6V0L0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms