Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam208bQ5DTT3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam208bQ5DTT3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam208bQ5DTT3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam208bQ5DTT3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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