Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

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Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zmat1Q3V0C1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zmat1Q3V0C1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zmat1Q3V0C1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zmat1Q3V0C1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms