Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt2Q3TTY5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt2Q3TTY5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt2Q3TTY5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt2Q3TTY5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms