Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 TSC10YBR265W 963 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 ATG23YLR431C 1362 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 URA6YKL024C 615 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 YIP3YNL044W 531 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 CSL4YNL232W 879 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 HER2YMR293C 1395 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 SEN2YLR105C 1134 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 VTA1YLR181C 993 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 YLR415CYLR415C 339 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 GLC8YMR311C 690 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 YBR089WYBR089W 600 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 MRS6YOR370C 1812 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 BRL1YHR036W 1416 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 MUM3YOR298W 1440 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-DR3Q12441 MTO1YGL236C 2010 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 YDL241WYDL241W 372 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 POM34YLR018C 900 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 HXT10YFL011W 1641 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 GPI18YBR004C 1302 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 MEP3YPR138C 1470 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 GID8YMR135C 1368 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 YNL226WYNL226W 411 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 IZH4YOL101C 939 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 QDR2YIL121W 1629 nt8□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 YER190C-AYER190C-A 576 nt8□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 SNF7YLR025W 723 nt8□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 YML133W-AYML133W-A 576 nt8□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 YDR008CYDR008C 351 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 DIN7YDR263C 1293 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 RBG2YGR173W 1107 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 MTG1YMR097C 1104 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 SSU72YNL222W 621 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 PHA2YNL316C 1005 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 ARL3YPL051W 597 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 MDL2YPL270W 2322 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 NCE102YPR149W 522 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 PTC4YBR125C 1182 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 SMF3YLR034C 1422 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 YDL121CYDL121C 450 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 YDR029WYDR029W 315 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 ORM1YGR038W 669 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 ARG3YJL088W 1017 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 CMK1YFR014C 1341 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 OXA1YER154W 1209 nt7.97□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 YLR118CYLR118C 684 nt7.97□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 AVO2YMR068W 1281 nt7.97□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 FMS1YMR020W 1527 nt7.97□□□□□ -1.13
TY1A-DR3Q12441 CBS1YDL069C 690 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 TRP1YDR007W 675 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 ERP5YHR110W 639 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 PPA2YMR267W 933 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 SLZ1YNL196C 897 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 PFA4YOL003C 1137 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 ATG19YOL082W 1248 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 YHR219WYHR219W 1875 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 YDR541CYDR541C 1035 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 MSP1YGR028W 1089 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 MDM35YKL053C-A 261 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 YOR072WYOR072W 315 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 ATG15YCR068W 1563 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 RFC1YOR217W 2586 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 YKL133CYKL133C 1392 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 CHA1YCL064C 1083 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 ADH4YGL256W 1149 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 PCP1YGR101W 1041 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 MEX67YPL169C 1800 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 RKM4YDR257C 1485 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 CTF18YMR078C 2226 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 MRPL32YCR003W 552 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 BTT1YDR252W 450 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 COG7YGL005C 840 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 LEU9YOR108W 1815 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 ESBP6YNL125C 2022 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 PCL9YDL179W 915 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 PPH22YDL188C 1134 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 SUI2YJR007W 915 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 MIR1YJR077C 936 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 CTL1YMR180C 963 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 TGS1YPL157W 948 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 OYE3YPL171C 1203 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 TIF5YPR041W 1218 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 GET3YDL100C 1065 nt7.91□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 TVP23YDR084C 600 nt7.91□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 MCM21YDR318W 1107 nt7.91□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 SPP2YOR148C 558 nt7.91□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 ILV2YMR108W 2064 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 MDM10YAL010C 1482 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 YCR006CYCR006C 474 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 PEX7YDR142C 1128 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 NDL1YLR254C 570 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1A-DR3Q12441 FLR1YBR008C 1647 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 MPC54YOR177C 1395 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 SHR3YDL212W 633 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 YDR220CYDR220C 294 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 MRP1YDR347W 966 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 UFD1YGR048W 1086 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 DCD1YHR144C 939 nt7.89□□□□□ -1.15
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