Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 EMC3YKL207W 762 nt8.17□□□□□ -1.1
LDB17Q12342 YLR460CYLR460C 1131 nt8.17□□□□□ -1.1
LDB17Q12342 RNA170RNA170 169 nt8.17□□□□□ -1.1
LDB17Q12342 YPL108WYPL108W 507 nt8.17□□□□□ -1.1
LDB17Q12342 snR86snR86 1004 nt8.16□□□□□ -1.1
LDB17Q12342 MET22YOL064C 1074 nt8.16□□□□□ -1.1
LDB17Q12342 ORT1YOR130C 879 nt8.16□□□□□ -1.1
LDB17Q12342 CHS7YHR142W 951 nt8.15□□□□□ -1.1
LDB17Q12342 BUB2YMR055C 921 nt8.15□□□□□ -1.1
LDB17Q12342 YMR166CYMR166C 1107 nt8.15□□□□□ -1.1
LDB17Q12342 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.14□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.14□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.14□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.14□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.14□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 OCH1YGL038C 1443 nt8.13□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 YJR149WYJR149W 1215 nt8.13□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 PDC6YGR087C 1692 nt8.12□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 YMR210WYMR210W 1350 nt8.11□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 CAK1YFL029C 1107 nt8.11□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 YJL009WYJL009W 327 nt8.11□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 YMR007WYMR007W 381 nt8.11□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 FIT1YDR534C 1587 nt8.1□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 UFD1YGR048W 1086 nt8.1□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 RRT14YIL127C 621 nt8.1□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 OLA1YBR025C 1185 nt8.1□□□□□ -1.11
LDB17Q12342 snR4snR4 186 nt8.08□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 FTH1YBR207W 1398 nt8.08□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 YJL160CYJL160C 864 nt8.07□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 LSP1YPL004C 1026 nt8.07□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 DUS3YLR401C 2007 nt8.07□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 MEP1YGR121C 1479 nt8.06□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 LEA1YPL213W 717 nt8.06□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 PUS7YOR243C 2031 nt8.05□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 YIA6YIL006W 1122 nt8.05□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 FCY1YPR062W 477 nt8.05□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 RCR1YBR005W 642 nt8.04□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 HIS3YOR202W 663 nt8.04□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 ABP1YCR088W 1779 nt8.04□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 EHT1YBR177C 1356 nt8.03□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 YER156CYER156C 1017 nt8.03□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 LRO1YNR008W 1986 nt8.02□□□□□ -1.12
LDB17Q12342 PET18YCR020C 648 nt8.02□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 DIA4YHR011W 1341 nt8.01□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 POP2YNR052C 1302 nt8.01□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 RHO1YPR165W 630 nt8□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 BUD31YCR063W 474 nt7.99□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 PUP3YER094C 618 nt7.99□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 RIB1YBL033C 1038 nt7.99□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 ADE16YLR028C 1776 nt7.99□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 BXI1YNL305C 894 nt7.98□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 DIP5YPL265W 1827 nt7.98□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 TOM71YHR117W 1920 nt7.97□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 SHC1YER096W 1539 nt7.97□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 LPD1YFL018C 1500 nt7.97□□□□□ -1.13
LDB17Q12342 RCF1YML030W 480 nt7.96□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 NSG2YNL156C 900 nt7.96□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 ATP2YJR121W 1536 nt7.95□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 GLY1YEL046C 1164 nt7.95□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 NDE2YDL085W 1638 nt7.95□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 YLR173WYLR173W 1827 nt7.94□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 THI73YLR004C 1572 nt7.94□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 YPT31YER031C 672 nt7.94□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 SOD2YHR008C 702 nt7.94□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 TDA4YJR116W 840 nt7.94□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 INO1YJL153C 1602 nt7.93□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 HXT8YJL214W 1710 nt7.93□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 RPS6AYPL090C 711 nt7.93□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 RPS6BYBR181C 711 nt7.93□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 TIM50YPL063W 1431 nt7.93□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 TIF3YPR163C 1311 nt7.92□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 TGL5YOR081C 2250 nt7.92□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.91□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 ERG6YML008C 1152 nt7.91□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 MFT1YML062C 1179 nt7.91□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 YPR084WYPR084W 1371 nt7.91□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 WSC3YOL105C 1671 nt7.91□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 MRN1YPL184C 1839 nt7.91□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 WSC4YHL028W 1818 nt7.9□□□□□ -1.14
LDB17Q12342 UTR5YEL035C 501 nt7.89□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 INM1YHR046C 888 nt7.89□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 YNL140CYNL140C 570 nt7.89□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 PRE10YOR362C 867 nt7.89□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 JHD1YER051W 1479 nt7.88□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 PFS2YNL317W 1398 nt7.88□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 ADA2YDR448W 1305 nt7.88□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 PMU1YKL128C 888 nt7.88□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.87□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.87□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.87□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 ARO3YDR035W 1113 nt7.87□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 ALG7YBR243C 1347 nt7.86□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 YGR137WYGR137W 375 nt7.86□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 YMR206WYMR206W 942 nt7.86□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 MDH2YOL126C 1134 nt7.86□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.85□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 HSV2YGR223C 1347 nt7.84□□□□□ -1.15
LDB17Q12342 ALR1YOL130W 2580 nt7.83□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 PMT7YDR307W 1989 nt7.83□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 MRP1YDR347W 966 nt7.83□□□□□ -1.16
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