Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 BUD20YLR074C 501 nt8.35□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 PAU21YOR394W 495 nt8.35□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 PAU22YPL282C 495 nt8.35□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 FRA1YLL029W 2250 nt8.34□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 NBA1YOL070C 1506 nt8.34□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 GNP1YDR508C 1992 nt8.34□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 TPN1YGL186C 1740 nt8.34□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 YER156CYER156C 1017 nt8.32□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 YJL009WYJL009W 327 nt8.32□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 BUB2YMR055C 921 nt8.32□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 BXI1YNL305C 894 nt8.32□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 RPS6AYPL090C 711 nt8.32□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 RPS6BYBR181C 711 nt8.32□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 YBR056WYBR056W 1506 nt8.31□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 MEP1YGR121C 1479 nt8.31□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 ADA2YDR448W 1305 nt8.29□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 snR86snR86 1004 nt8.29□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 MFT1YML062C 1179 nt8.29□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 YOR343CYOR343C 327 nt8.29□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 RHO1YPR165W 630 nt8.29□□□□□ -1.08
VPS54Q12071 HRA1HRA1 564 nt8.27□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 SHC1YER096W 1539 nt8.27□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 MRP1YDR347W 966 nt8.26□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 UFD1YGR048W 1086 nt8.26□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 FET5YFL041W 1869 nt8.26□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 TRP2YER090W 1524 nt8.25□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 YPT31YER031C 672 nt8.25□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 THI73YLR004C 1572 nt8.25□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 GDH1YOR375C 1365 nt8.24□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 YPR084WYPR084W 1371 nt8.24□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 Q0010Q0010 387 nt8.24□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 THI6YPL214C 1623 nt8.23□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 ATP2YJR121W 1536 nt8.23□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 ELP4YPL101W 1371 nt8.22□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 YLR072WYLR072W 2082 nt8.22□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 PUP3YER094C 618 nt8.22□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 YMR206WYMR206W 942 nt8.22□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 MIM1YOL026C 342 nt8.22□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 PUS7YOR243C 2031 nt8.22□□□□□ -1.09
VPS54Q12071 LPD1YFL018C 1500 nt8.21□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.21□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.21□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.21□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.21□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.21□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.21□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.21□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 FIT1YDR534C 1587 nt8.21□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 EHT1YBR177C 1356 nt8.21□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 TAD2YJL035C 753 nt8.2□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 LRO1YNR008W 1986 nt8.2□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.19□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 HXT11YOL156W 1704 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.18□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 HXT8YJL214W 1710 nt8.17□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 YIL168WYIL168W 384 nt8.17□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 TDH1YJL052W 999 nt8.17□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 JHD1YER051W 1479 nt8.16□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 RPL12BYDR418W 498 nt8.15□□□□□ -1.1
VPS54Q12071 HBS1YKR084C 1836 nt8.15□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 TIM50YPL063W 1431 nt8.14□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 TOS1YBR162C 1368 nt8.14□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.14□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 ADE1YAR015W 921 nt8.14□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 ABP1YCR088W 1779 nt8.14□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 SRM1YGL097W 1449 nt8.13□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 KAE1YKR038C 1161 nt8.13□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 INO1YJL153C 1602 nt8.13□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 HIS3YOR202W 663 nt8.12□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 PRE10YOR362C 867 nt8.12□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 DIP5YPL265W 1827 nt8.12□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 BUD31YCR063W 474 nt8.11□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 NSG2YNL156C 900 nt8.11□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 LEA1YPL213W 717 nt8.11□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 TOM71YHR117W 1920 nt8.11□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 RCF1YML030W 480 nt8.1□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 YJL043WYJL043W 774 nt8.09□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 PMU1YKL128C 888 nt8.09□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 NUP53YMR153W 1428 nt8.09□□□□□ -1.11
VPS54Q12071 YJR154WYJR154W 1041 nt8.07□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 NDE2YDL085W 1638 nt8.07□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 YLR173WYLR173W 1827 nt8.06□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 ALR1YOL130W 2580 nt8.06□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 DUR3YHL016C 2208 nt8.06□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 ARO3YDR035W 1113 nt8.05□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 DUS3YLR401C 2007 nt8.04□□□□□ -1.12
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