Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 HMG2YLR450W 3138 nt9.69□□□□□ -0.86
CTI6Q08923 RPD3YNL330C 1302 nt9.68□□□□□ -0.86
CTI6Q08923 YML079WYML079W 606 nt9.68□□□□□ -0.86
CTI6Q08923 SFP1YLR403W 2052 nt9.67□□□□□ -0.86
CTI6Q08923 OLA1YBR025C 1185 nt9.67□□□□□ -0.86
CTI6Q08923 PSP2YML017W 1782 nt9.65□□□□□ -0.86
CTI6Q08923 YLR358CYLR358C 564 nt9.65□□□□□ -0.86
CTI6Q08923 YPT31YER031C 672 nt9.64□□□□□ -0.87
CTI6Q08923 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.64□□□□□ -0.87
CTI6Q08923 AGP3YFL055W 1677 nt9.62□□□□□ -0.87
CTI6Q08923 HAC1YFL031W 717 nt9.62□□□□□ -0.87
CTI6Q08923 URA1YKL216W 945 nt9.62□□□□□ -0.87
CTI6Q08923 RPC31YNL151C 756 nt9.6□□□□□ -0.87
CTI6Q08923 THI3YDL080C 1830 nt9.59□□□□□ -0.87
CTI6Q08923 TPO4YOR273C 1980 nt9.59□□□□□ -0.87
CTI6Q08923 KRR1YCL059C 951 nt9.58□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 PIH1YHR034C 1035 nt9.58□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 CYT1YOR065W 930 nt9.57□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 RHO1YPR165W 630 nt9.57□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 LEU4YNL104C 1860 nt9.57□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 YJL144WYJL144W 315 nt9.56□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 LAT1YNL071W 1449 nt9.56□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 GGA2YHR108W 1758 nt9.55□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 SLM3YDL033C 1254 nt9.55□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 YIR035CYIR035C 765 nt9.55□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 CPT1YNL130C 1182 nt9.55□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 JHD1YER051W 1479 nt9.54□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 SHC1YER096W 1539 nt9.54□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 FET5YFL041W 1869 nt9.53□□□□□ -0.88
CTI6Q08923 PMU1YKL128C 888 nt9.52□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 PUP3YER094C 618 nt9.51□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 NCA3YJL116C 1014 nt9.51□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 TIM50YPL063W 1431 nt9.5□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 PNS1YOR161C 1620 nt9.5□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 YOR111WYOR111W 699 nt9.5□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt9.49□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 ESBP6YNL125C 2022 nt9.49□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 SPR1YOR190W 1338 nt9.49□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 THI73YLR004C 1572 nt9.49□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt9.48□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 NPP2YEL016C 1482 nt9.47□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 MET2YNL277W 1461 nt9.47□□□□□ -0.89
CTI6Q08923 TMS1YDR105C 1422 nt9.46□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 ATP23YNR020C 813 nt9.45□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 AAC3YBR085W 924 nt9.45□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.44□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.44□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 GPM1YKL152C 744 nt9.44□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 YOX1YML027W 1158 nt9.44□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 NBA1YOL070C 1506 nt9.44□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 SPG1YGR236C 288 nt9.43□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 SRY1YKL218C 981 nt9.42□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 BUB2YMR055C 921 nt9.42□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 PUS4YNL292W 1212 nt9.42□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 PRE10YOR362C 867 nt9.42□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 CRN1YLR429W 1956 nt9.42□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 UME1YPL139C 1383 nt9.4□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 APT1YML022W 564 nt9.4□□□□□ -0.9
CTI6Q08923 YBR056WYBR056W 1506 nt9.38□□□□□ -0.91
CTI6Q08923 HXT8YJL214W 1710 nt9.37□□□□□ -0.91
CTI6Q08923 MEP1YGR121C 1479 nt9.37□□□□□ -0.91
CTI6Q08923 MCP1YOR228C 909 nt9.37□□□□□ -0.91
CTI6Q08923 NPP1YCR026C 2229 nt9.35□□□□□ -0.91
CTI6Q08923 MAS2YHR024C 1449 nt9.35□□□□□ -0.91
CTI6Q08923 YBL111CYBL111C 2004 nt9.35□□□□□ -0.91
CTI6Q08923 ADH6YMR318C 1083 nt9.34□□□□□ -0.91
CTI6Q08923 YPQ1YOL092W 927 nt9.34□□□□□ -0.91
CTI6Q08923 YLR072WYLR072W 2082 nt9.34□□□□□ -0.91
CTI6Q08923 PTH2YBL057C 627 nt9.33□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 EHT1YBR177C 1356 nt9.33□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 YDR467CYDR467C 327 nt9.32□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 POR2YIL114C 846 nt9.32□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 CYS3YAL012W 1185 nt9.32□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 ALD5YER073W 1563 nt9.32□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 HXT11YOL156W 1704 nt9.31□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 INH1YDL181W 258 nt9.31□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 TRP2YER090W 1524 nt9.31□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 ZIM17YNL310C 525 nt9.3□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 LRO1YNR008W 1986 nt9.3□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 MTO1YGL236C 2010 nt9.29□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.28□□□□□ -0.92
CTI6Q08923 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 NMA2YGR010W 1188 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 MBF1YOR298C-A 456 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 SRM1YGL097W 1449 nt9.27□□□□□ -0.93
CTI6Q08923 HXK1YFR053C 1458 nt9.27□□□□□ -0.93
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