Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
COL16A1Q07092 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
COL16A1Q07092 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
COL16A1Q07092 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
COL16A1Q07092 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
COL16A1Q07092 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
COL16A1Q07092 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
COL16A1Q07092 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
COL16A1Q07092 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
COL16A1Q07092 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
COL16A1Q07092 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
COL16A1Q07092 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
COL16A1Q07092 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms