Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHDQ02161 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHDQ02161 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHDQ02161 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHDQ02161 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHDQ02161 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHDQ02161 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHDQ02161 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHDQ02161 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHDQ02161 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RHDQ02161 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHDQ02161 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHDQ02161 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHDQ02161 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHDQ02161 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHDQ02161 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHDQ02161 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHDQ02161 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHDQ02161 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHDQ02161 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHDQ02161 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHDQ02161 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHDQ02161 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHDQ02161 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHDQ02161 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHDQ02161 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHDQ02161 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHDQ02161 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RHDQ02161 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RHDQ02161 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHDQ02161 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHDQ02161 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHDQ02161 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHDQ02161 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHDQ02161 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHDQ02161 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHDQ02161 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHDQ02161 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHDQ02161 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHDQ02161 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHDQ02161 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHDQ02161 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHDQ02161 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHDQ02161 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHDQ02161 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHDQ02161 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHDQ02161 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHDQ02161 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHDQ02161 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHDQ02161 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHDQ02161 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHDQ02161 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHDQ02161 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RHDQ02161 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHDQ02161 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHDQ02161 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHDQ02161 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHDQ02161 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHDQ02161 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHDQ02161 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RHDQ02161 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHDQ02161 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHDQ02161 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHDQ02161 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHDQ02161 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RHDQ02161 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHDQ02161 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHDQ02161 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHDQ02161 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHDQ02161 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHDQ02161 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHDQ02161 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHDQ02161 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHDQ02161 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHDQ02161 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHDQ02161 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHDQ02161 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHDQ02161 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RHDQ02161 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHDQ02161 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHDQ02161 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHDQ02161 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHDQ02161 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHDQ02161 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RHDQ02161 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHDQ02161 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHDQ02161 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHDQ02161 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHDQ02161 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHDQ02161 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHDQ02161 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHDQ02161 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHDQ02161 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHDQ02161 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHDQ02161 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHDQ02161 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHDQ02161 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHDQ02161 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHDQ02161 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHDQ02161 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms