Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EgfrQ01279 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EgfrQ01279 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EgfrQ01279 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EgfrQ01279 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EgfrQ01279 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EgfrQ01279 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
EgfrQ01279 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EgfrQ01279 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EgfrQ01279 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EgfrQ01279 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EgfrQ01279 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
EgfrQ01279 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EgfrQ01279 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
EgfrQ01279 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EgfrQ01279 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EgfrQ01279 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EgfrQ01279 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EgfrQ01279 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EgfrQ01279 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EgfrQ01279 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EgfrQ01279 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EgfrQ01279 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EgfrQ01279 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.2 ms