Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MDM2Q00987 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MDM2Q00987 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MDM2Q00987 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 327.5 ms