Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1bP70700 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1bP70700 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1bP70700 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1bP70700 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms