Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Surf6P70279 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Surf6P70279 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Surf6P70279 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Surf6P70279 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf6P70279 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Surf6P70279 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Surf6P70279 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Surf6P70279 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms