Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRP55822 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH3BGRP55822 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3BGRP55822 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms