Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArsaP50428 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArsaP50428 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ArsaP50428 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArsaP50428 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArsaP50428 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArsaP50428 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArsaP50428 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ArsaP50428 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ArsaP50428 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArsaP50428 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArsaP50428 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArsaP50428 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ArsaP50428 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArsaP50428 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArsaP50428 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArsaP50428 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArsaP50428 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArsaP50428 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArsaP50428 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArsaP50428 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArsaP50428 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArsaP50428 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArsaP50428 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArsaP50428 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArsaP50428 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArsaP50428 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArsaP50428 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArsaP50428 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArsaP50428 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArsaP50428 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArsaP50428 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArsaP50428 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArsaP50428 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArsaP50428 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArsaP50428 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArsaP50428 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArsaP50428 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArsaP50428 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArsaP50428 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArsaP50428 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArsaP50428 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArsaP50428 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArsaP50428 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms