Protein–RNA interactions for Protein: P47027

DPB11, DNA replication regulator DPB11, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB11P47027 YPT11YNL304W 1254 nt7.34□□□□□ -1.23
DPB11P47027 PUP1YOR157C 786 nt7.34□□□□□ -1.23
DPB11P47027 GAS1YMR307W 1680 nt7.34□□□□□ -1.23
DPB11P47027 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.34□□□□□ -1.23
DPB11P47027 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.34□□□□□ -1.23
DPB11P47027 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.34□□□□□ -1.23
DPB11P47027 SDS24YBR214W 1584 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB11P47027 ABP1YCR088W 1779 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB11P47027 YKR012CYKR012C 378 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB11P47027 HIS3YOR202W 663 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB11P47027 PTC6YCR079W 1329 nt7.32□□□□□ -1.24
DPB11P47027 ADH3YMR083W 1128 nt7.32□□□□□ -1.24
DPB11P47027 HSV2YGR223C 1347 nt7.31□□□□□ -1.24
DPB11P47027 MDH2YOL126C 1134 nt7.31□□□□□ -1.24
DPB11P47027 CSM2YIL132C 642 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB11P47027 YJL009WYJL009W 327 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB11P47027 TOM71YHR117W 1920 nt7.29□□□□□ -1.24
DPB11P47027 MOB1YIL106W 945 nt7.29□□□□□ -1.24
DPB11P47027 CYC3YAL039C 810 nt7.29□□□□□ -1.24
DPB11P47027 VBA3YCL069W 1377 nt7.29□□□□□ -1.24
DPB11P47027 ENO1YGR254W 1314 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB11P47027 YCR025CYCR025C 411 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB11P47027 LYS20YDL182W 1287 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB11P47027 SRP102YKL154W 735 nt7.27□□□□□ -1.25
DPB11P47027 SNU66YOR308C 1764 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB11P47027 SLM3YDL033C 1254 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB11P47027 NDE2YDL085W 1638 nt7.25□□□□□ -1.25
DPB11P47027 YBR056WYBR056W 1506 nt7.25□□□□□ -1.25
DPB11P47027 RSM7YJR113C 744 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB11P47027 MET30YIL046W 1923 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB11P47027 YFR020WYFR020W 699 nt7.23□□□□□ -1.25
DPB11P47027 YNL190WYNL190W 615 nt7.23□□□□□ -1.25
DPB11P47027 TIF3YPR163C 1311 nt7.23□□□□□ -1.25
DPB11P47027 PMT7YDR307W 1989 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB11P47027 YCP4YCR004C 744 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB11P47027 SER2YGR208W 930 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB11P47027 YNL140CYNL140C 570 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB11P47027 SLG1YOR008C 1137 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB11P47027 LAS17YOR181W 1902 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB11P47027 MEP1YGR121C 1479 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB11P47027 YJR149WYJR149W 1215 nt7.21□□□□□ -1.26
DPB11P47027 COG1YGL223C 1254 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB11P47027 YIR035CYIR035C 765 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB11P47027 YLR280CYLR280C 351 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB11P47027 BUB2YMR055C 921 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB11P47027 HTS1YPR033C 1641 nt7.19□□□□□ -1.26
DPB11P47027 MLS1YNL117W 1665 nt7.19□□□□□ -1.26
DPB11P47027 BUD31YCR063W 474 nt7.19□□□□□ -1.26
DPB11P47027 ERO1YML130C 1692 nt7.19□□□□□ -1.26
DPB11P47027 ADE2YOR128C 1716 nt7.18□□□□□ -1.26
DPB11P47027 GLY1YEL046C 1164 nt7.18□□□□□ -1.26
DPB11P47027 INO1YJL153C 1602 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB11P47027 SWM1YDR260C 513 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB11P47027 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB11P47027 INM1YHR046C 888 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB11P47027 AIM34YMR003W 597 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB11P47027 MRN1YPL184C 1839 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB11P47027 SAM50YNL026W 1455 nt7.16□□□□□ -1.26
DPB11P47027 TGL5YOR081C 2250 nt7.16□□□□□ -1.26
DPB11P47027 RTG2YGL252C 1767 nt7.15□□□□□ -1.26
DPB11P47027 CBK1YNL161W 2271 nt7.15□□□□□ -1.26
DPB11P47027 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.14□□□□□ -1.27
DPB11P47027 YGR210CYGR210C 1236 nt7.14□□□□□ -1.27
DPB11P47027 YLR460CYLR460C 1131 nt7.14□□□□□ -1.27
DPB11P47027 TDA4YJR116W 840 nt7.13□□□□□ -1.27
DPB11P47027 LRO1YNR008W 1986 nt7.13□□□□□ -1.27
DPB11P47027 WSC4YHL028W 1818 nt7.13□□□□□ -1.27
DPB11P47027 YMR007WYMR007W 381 nt7.12□□□□□ -1.27
DPB11P47027 YPL264CYPL264C 1062 nt7.12□□□□□ -1.27
DPB11P47027 MET13YGL125W 1803 nt7.12□□□□□ -1.27
DPB11P47027 ITR1YDR497C 1755 nt7.11□□□□□ -1.27
DPB11P47027 CHS7YHR142W 951 nt7.11□□□□□ -1.27
DPB11P47027 FAF1YIL019W 1041 nt7.11□□□□□ -1.27
DPB11P47027 PRC1YMR297W 1599 nt7.11□□□□□ -1.27
DPB11P47027 YMR166CYMR166C 1107 nt7.1□□□□□ -1.27
DPB11P47027 YPL108WYPL108W 507 nt7.1□□□□□ -1.27
DPB11P47027 YTH1YPR107C 627 nt7.1□□□□□ -1.27
DPB11P47027 DIP5YPL265W 1827 nt7.1□□□□□ -1.27
DPB11P47027 PMA2YPL036W 2844 nt7.09□□□□□ -1.27
DPB11P47027 YIA6YIL006W 1122 nt7.09□□□□□ -1.27
DPB11P47027 MGM101YJR144W 810 nt7.09□□□□□ -1.27
DPB11P47027 RCR1YBR005W 642 nt7.09□□□□□ -1.27
DPB11P47027 KTR4YBR199W 1395 nt7.08□□□□□ -1.28
DPB11P47027 BEM1YBR200W 1656 nt7.08□□□□□ -1.28
DPB11P47027 YJL045WYJL045W 1905 nt7.07□□□□□ -1.28
DPB11P47027 RRT6YGL146C 936 nt7.07□□□□□ -1.28
DPB11P47027 SPE4YLR146C 903 nt7.07□□□□□ -1.28
DPB11P47027 OLA1YBR025C 1185 nt7.07□□□□□ -1.28
DPB11P47027 HXT9YJL219W 1704 nt7.07□□□□□ -1.28
DPB11P47027 EHT1YBR177C 1356 nt7.07□□□□□ -1.28
DPB11P47027 SGF73YGL066W 1974 nt7.06□□□□□ -1.28
DPB11P47027 CHA1YCL064C 1083 nt7.06□□□□□ -1.28
DPB11P47027 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.06□□□□□ -1.28
DPB11P47027 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.06□□□□□ -1.28
DPB11P47027 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.06□□□□□ -1.28
DPB11P47027 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.06□□□□□ -1.28
DPB11P47027 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.06□□□□□ -1.28
DPB11P47027 MET22YOL064C 1074 nt7.06□□□□□ -1.28
DPB11P47027 FRT1YOR324C 1809 nt7.06□□□□□ -1.28
DPB11P47027 YHR131CYHR131C 2553 nt7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms