Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XCR1P46094 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XCR1P46094 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XCR1P46094 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XCR1P46094 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XCR1P46094 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
XCR1P46094 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XCR1P46094 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XCR1P46094 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XCR1P46094 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XCR1P46094 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XCR1P46094 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XCR1P46094 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XCR1P46094 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XCR1P46094 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XCR1P46094 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XCR1P46094 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XCR1P46094 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XCR1P46094 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XCR1P46094 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XCR1P46094 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XCR1P46094 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XCR1P46094 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XCR1P46094 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XCR1P46094 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XCR1P46094 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XCR1P46094 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
XCR1P46094 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
XCR1P46094 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
XCR1P46094 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XCR1P46094 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XCR1P46094 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XCR1P46094 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XCR1P46094 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XCR1P46094 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XCR1P46094 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XCR1P46094 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XCR1P46094 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XCR1P46094 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XCR1P46094 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XCR1P46094 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XCR1P46094 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XCR1P46094 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XCR1P46094 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XCR1P46094 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XCR1P46094 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XCR1P46094 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XCR1P46094 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XCR1P46094 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XCR1P46094 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XCR1P46094 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XCR1P46094 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XCR1P46094 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XCR1P46094 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
XCR1P46094 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XCR1P46094 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
XCR1P46094 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
XCR1P46094 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XCR1P46094 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XCR1P46094 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XCR1P46094 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XCR1P46094 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XCR1P46094 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XCR1P46094 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XCR1P46094 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
XCR1P46094 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XCR1P46094 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XCR1P46094 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XCR1P46094 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XCR1P46094 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XCR1P46094 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XCR1P46094 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XCR1P46094 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XCR1P46094 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XCR1P46094 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XCR1P46094 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XCR1P46094 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XCR1P46094 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XCR1P46094 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XCR1P46094 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XCR1P46094 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XCR1P46094 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XCR1P46094 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XCR1P46094 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XCR1P46094 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XCR1P46094 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XCR1P46094 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XCR1P46094 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XCR1P46094 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XCR1P46094 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XCR1P46094 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XCR1P46094 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XCR1P46094 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XCR1P46094 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XCR1P46094 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XCR1P46094 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XCR1P46094 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XCR1P46094 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XCR1P46094 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XCR1P46094 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms