Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCLP18206 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCLP18206 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCLP18206 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCLP18206 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCLP18206 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCLP18206 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCLP18206 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCLP18206 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCLP18206 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCLP18206 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCLP18206 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCLP18206 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCLP18206 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCLP18206 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCLP18206 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCLP18206 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VCLP18206 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCLP18206 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCLP18206 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCLP18206 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCLP18206 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCLP18206 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCLP18206 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCLP18206 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCLP18206 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCLP18206 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCLP18206 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCLP18206 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCLP18206 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCLP18206 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCLP18206 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCLP18206 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCLP18206 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCLP18206 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
VCLP18206 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
VCLP18206 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCLP18206 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VCLP18206 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCLP18206 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VCLP18206 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCLP18206 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCLP18206 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCLP18206 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCLP18206 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCLP18206 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCLP18206 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCLP18206 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VCLP18206 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCLP18206 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCLP18206 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCLP18206 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCLP18206 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCLP18206 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCLP18206 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VCLP18206 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCLP18206 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCLP18206 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCLP18206 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCLP18206 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VCLP18206 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCLP18206 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCLP18206 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCLP18206 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCLP18206 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCLP18206 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCLP18206 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCLP18206 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCLP18206 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCLP18206 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCLP18206 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCLP18206 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VCLP18206 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCLP18206 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCLP18206 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VCLP18206 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCLP18206 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCLP18206 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCLP18206 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCLP18206 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCLP18206 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCLP18206 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCLP18206 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCLP18206 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCLP18206 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCLP18206 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCLP18206 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCLP18206 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VCLP18206 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VCLP18206 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VCLP18206 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCLP18206 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCLP18206 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCLP18206 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCLP18206 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCLP18206 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCLP18206 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCLP18206 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCLP18206 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCLP18206 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms