Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
ACTN1P12814 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACTN1P12814 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTN1P12814 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTN1P12814 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACTN1P12814 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACTN1P12814 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACTN1P12814 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACTN1P12814 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ACTN1P12814 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTN1P12814 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTN1P12814 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTN1P12814 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ACTN1P12814 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACTN1P12814 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACTN1P12814 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms