Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srpk1O70551 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srpk1O70551 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srpk1O70551 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srpk1O70551 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srpk1O70551 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms