Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdzd7E9Q9W7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzd7E9Q9W7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd7E9Q9W7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzd7E9Q9W7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms