Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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