Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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