Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TM6SF1Q9BZW5 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms