Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAVIN4Q5BKX8 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms