Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CA9Q16790 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CA9Q16790 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CA9Q16790 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms