Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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FSCN1Q16658 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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FSCN1Q16658 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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FSCN1Q16658 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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