Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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