Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL157400.2-201ENST00000454174 563 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 CHIAP1-201ENST00000456220 995 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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