Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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