Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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