Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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