Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms