Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms